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SafeStain? GelStain? 核酸染料(>SafeRed), Page膠肉眼可觀測條帶(不需要激發(fā)光)

SafeStain? GelStain? 核酸染料(>SafeRed), Page膠肉眼可觀測條帶(不需要激發(fā)光)

SafeStain??GelStain??Nucleic Acid GelStain??????????????????????SafeRed?, SafeView?, SafeStain?和GelStain?為北京富百科生物技術(shù)有限公司注冊(cè)商標(biāo),未經(jīng)授權(quán)嚴(yán)禁使用!SafeStain?核酸染料特點(diǎn)1. 帶形美觀:富百科專利產(chǎn)品第四代核酸染料SafeStain克服了國外同類染料分不開大片段DNA的缺點(diǎn),電泳條帶清晰整齊美觀。(發(fā)明專利ZL202210145256.6)2.方便觀測:用手持紫外燈或者手持藍(lán)光儀都可以隨時(shí)觀察電泳情況。3. 相對(duì)安全:獨(dú)特油性大分子(分子量>1000)使其不能穿透細(xì)胞膜進(jìn)入細(xì)胞, 富百科Ames-test...

SafeStain??GelStain??Nucleic Acid GelStain

??????????????????????SafeRed?, SafeView?, SafeStain?和GelStain?為北京富百科生物技術(shù)有限公司注冊(cè)商標(biāo),未經(jīng)授權(quán)嚴(yán)禁使用!

SafeStain?酸染料特點(diǎn)

1. 帶形美觀:富百科專利產(chǎn)品第四代核酸染料SafeStain克服了國外同類染料分不開大片段DNA的缺點(diǎn),電泳條帶清晰整齊美觀。(發(fā)明專利ZL202210145256.6)

2.方便觀測:用手持紫外燈或者手持藍(lán)光儀都可以隨時(shí)觀察電泳情況。

3. 相對(duì)安全:獨(dú)特油性大分子(分子量>1000)使其不能穿透細(xì)胞膜進(jìn)入細(xì)胞, 富百科Ames-test實(shí)驗(yàn)表明,在凝膠染色濃度下該染料的沒有EB類似的誘變性,使用安全,可以代替致癌物溴化乙錠EB作為各種核酸電泳的染色劑。

4.?完美兼容:兼容Red和Green---SafeStain同時(shí)適用于紫外成像儀/激光成像儀和藍(lán)光儀!同時(shí)擁有EB和Sybr Green類似的光譜,無需改變?yōu)V光片及觀察裝置:標(biāo)準(zhǔn) EB?濾光片或?SYBR?濾光片都適用。

5. ?Page膠肉眼可觀測條帶(不需要激發(fā)光,包括紫外和藍(lán)光)。

6.????遷移率好:EB小分子很快跑出膠外,所以EB容易導(dǎo)致小DNA片段看不清,大分子SafeStain完全克服這一點(diǎn)。

7.????定量準(zhǔn)確:適用于核酸分子大小的確定和定量,EB對(duì)小DNA片段定量不準(zhǔn)確。

8.??染色均勻:電泳時(shí)染色均勻,整片膠的背景一樣。EB會(huì)導(dǎo)致膠的整體背景不同,經(jīng)常出現(xiàn)陰陽背景(膠的背景部分亮,另一部分暗);EB長時(shí)間、長距離的電泳,EB信號(hào)強(qiáng)度會(huì)相應(yīng)下降。我們的大分子SafeStain完全克服這一點(diǎn)。

9. 靈敏度高:適用于各種大小片段的電泳染色,對(duì)核酸遷移的影響小于SYBR Green I。

10.????穩(wěn)定性高:適用于使用微波或其它加熱方法制備瓊脂糖凝膠;室溫下在酸或堿緩沖液中穩(wěn)定。

11.???耐光性強(qiáng):實(shí)驗(yàn)室的日常環(huán)境下可以常溫放置24個(gè)月。

12.????信噪比好:樣品熒光信號(hào)強(qiáng),背景信號(hào)低,肉眼可觀測到亮度明顯比EB強(qiáng),EB會(huì)導(dǎo)致膠的整體背景稍微高些,經(jīng)常出現(xiàn)陰陽背景。

13.???操作簡單:與EB用法完全一樣,在預(yù)制膠和電泳過程中染料不降解;而電泳后染色過程也只需30?分鐘且無需脫色或沖洗。

14.???適用范圍廣:可選擇電泳前染色(膠染法)或電泳后染色(泡染法);適用于瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠電泳;可用于?dsDNA、ssDNA?或?RNA?染色。

產(chǎn)品包裝:???SafeStain?10000x Nucleic Acid Gel Stain??500uL/支;????????儲(chǔ)存條件:??室溫避光可保存24個(gè)月。

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操作步驟:

一.膠染法(推薦方法,用法類似EB)

制膠時(shí)加入SafeStain核酸染料(染料靈敏,每100mL?瓊脂糖溶液中加入10μL SafeStain原裝液即可)。 按常規(guī)方法電泳。

1.?實(shí)驗(yàn)室材料和試劑:

1)????實(shí)驗(yàn)樣品:質(zhì)粒DNA,DNA marker(國產(chǎn)的DNA marker濃度太高,至少稀釋2~3倍后使用!)

(2)????TBE緩沖液配置:10X TBE電泳緩沖液[Tris 107.8146g (890mM),硼酸55.0287g(890mM),EDTA 5.845g(20mM),加NaOH約4g調(diào)節(jié)pH=8.3;定容1000mL];用ddH2O稀釋10倍配制1X TBE電泳緩沖液。?

(3)????TAE緩沖液配置:50X TAE電泳緩沖液[Tris 242g (2M),EDTA 37.2g(100mM),加醋酸約57ml調(diào)節(jié)pH=8.5;定容1000mL];用ddH2O稀釋50倍配制1X TAE電泳緩沖液。

(4)????溴酚藍(lán)指示劑,1%的西班牙瓊脂糖凝膠

(5)????儀器:電泳儀(130v),移液器(0.5~10ul),凝膠成像儀

2.?實(shí)驗(yàn)步驟:

(1)????制膠:將0.5g瓊脂糖溶于50mL 1X TBE電泳緩沖液中,加熱至瓊脂糖完全融化。將融好的瓊脂糖溶液室溫放置50℃左右加入5ul的SafeStain凝膠電泳染料,搖勻。

(2)????倒膠:將制好的瓊脂糖凝膠緩慢倒于制膠托盤內(nèi),避免產(chǎn)生氣泡。將點(diǎn)樣梳子垂直置于電泳膠膜的一端,距離托盤底部約1mm。放置時(shí)盡量保持平穩(wěn),切勿晃動(dòng)。

(3)????置膠:待約30分鐘左右膠體充分凝固后,緩慢垂直向上拔起點(diǎn)樣梳子,切勿用力過猛。(夏季適當(dāng)延長凝膠時(shí)間)

(4)????將瓊脂糖凝膠放入電泳槽內(nèi),加入電泳緩沖液,使電泳緩沖液液面高于凝膠面約1~2mm。

(5)????將混合溴酚藍(lán)指示劑的DNA樣本(1ul溴酚藍(lán)與2ul DNA標(biāo)本混合)加入到點(diǎn)樣孔內(nèi)。

(6)????蓋上電泳槽蓋,開啟電源,使DNA從負(fù)極移向正極恒壓電泳(電壓恒定在120~130v之間,一般可選擇130V)。

(7)????當(dāng)DNA條帶距離點(diǎn)樣孔約1~2cm后關(guān)閉電源,(約30~40分鐘)取出凝膠。

(8)????用?302nm?激發(fā)的?UV?凝膠成像系統(tǒng)觀察結(jié)果。

*注:此方法染色染料用量相對(duì)較少。染料加入膠中可直接使用微波爐加熱,制好的膠溶液可以在室溫下保存直至用完。

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優(yōu)化電泳條件參考事項(xiàng):?

ü??因?yàn)?/span>EB是插入DNA內(nèi)部變成一個(gè)整體分子,所以不容易出現(xiàn)遷移/彌散的問題,而大分子的SafeStainDNA是通過靜電吸引非共價(jià)結(jié)合的,在DNA外面偶爾出現(xiàn)條帶遷移,特別是大片段DNA!

ü??染料過于靈敏,建議marker濃度稀釋一倍,特別是含大片段多的marker!國產(chǎn)的marker是基于EB染料開發(fā)的酶切的混合片段,濃度偏高;另外,EB顯示不出來酶切的混合片段的雜帶,SafeStain的高靈敏性會(huì)顯示出來。少數(shù)情況下質(zhì)粒經(jīng)某些酶切后的DNA樣品會(huì)出現(xiàn)拖尾和分辨率降低,請(qǐng)使用后染法。

ü??染料過于靈敏,建議未知濃度的樣品的稀釋一倍后上樣,特別是含大片段多的樣品。推薦上樣量為50~200ng/泳道(8泳道小膠孔)

ü??與EB相比,SafeStain電泳電壓要低一些,電泳時(shí)電壓不宜過高,一般不要超過130V。跑膠的時(shí)間40~60min。

ü??SafeStain染料和樣品混合后,點(diǎn)樣到瓊脂糖凝膠中,不推薦這種點(diǎn)樣法。

ü??由于SafeStain具有良好的熱穩(wěn)定性,可以在熱的瓊脂糖溶液中直接添加,而不需要等待溶液冷卻。搖晃振蕩以保證染料充分混勻??梢詫afeStain原液加到瓊脂糖粉末和電泳緩沖液中,用微波爐加熱以制備瓊脂糖凝膠。SafeStain兼容所有常用的電泳緩沖溶液。

ü??如果總是看到條帶彌散或分離不理想,為了避免染料可能對(duì)DNA遷移的干擾,建議使用電泳后染膠。使用后染法(泡染法)染色以確認(rèn)問題是否與染料有關(guān)。如果染色后問題依舊存在,則說明問題與染料無關(guān)!

*此方法不適合預(yù)制聚丙烯酰胺凝膠,對(duì)于聚丙烯酰胺凝膠請(qǐng)使用泡染法。

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二.泡染法

(1)按照常規(guī)方法進(jìn)行電泳。?(用于膠回收等DNA高濃度的樣品實(shí)驗(yàn)強(qiáng)烈推薦泡染的方法?。?/span>

(2)用H2O將SafeStain?10,000×?儲(chǔ)液稀釋約1萬倍到0.1M NaCl溶液中,制成1×?染色液。(例如將5μL SafeStain?10,000×?原液加入到50mL 0.1M NaCl溶液中)。

(3)將凝膠小心地放入合適的容器中,如聚丙烯容器中。緩慢加入足量的1×?染色液浸沒凝膠。室溫振蕩染色30min左右,最佳染色時(shí)間根據(jù)凝膠厚度以及瓊脂糖濃度不同而略有不同。對(duì)于含3.5~10%丙烯酰胺的凝膠,染色時(shí)間通常介于30min到1h,并隨丙烯酰胺含量增加而延長。

(4)用?302nm?激發(fā)的?UV?凝膠成像系統(tǒng)或者藍(lán)光儀下觀察結(jié)果。

*注意事項(xiàng):用泡染法染色時(shí),染料用量較多。單次使用的染色液可重復(fù)使用3次左右;1× SafeStain?染色液可以大量制備,在室溫下避光保存直至用完。

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三.核酸電泳的PAGE步驟:Page膠實(shí)驗(yàn)室燈光下,肉眼可觀測條帶,不需要外源激發(fā)光(包括紫外和藍(lán)光)。

1)將TBE制備的凝膠放入電泳槽中,用夾子夾住邊緣。

2)用配置凝膠溶液同一批次的5×TBE灌滿緩沖液槽。用注射器排除凝膠底部的氣泡。

3)用注射器吸取1×TBE沖洗加樣孔。將DNA樣品和適量的6×凝膠上樣緩沖液混合,用微量移液管加入加樣孔。

4)將電極與電源相連(正極接下槽),打開電源一般90V;1~8V/cm。進(jìn)行電泳9h。

5)電泳至標(biāo)準(zhǔn)參照染料遷移至所需位置(一般是電泳到二甲苯完全遷出,溴酚藍(lán)距底邊2~3cm停止)。關(guān)閉電源,拔掉插頭,棄去電泳槽中的電泳液。

6)將凝膠取下來放入,染色皿中,加1X SafeStain的1X緩沖液中的振蕩染色30-60分,放置在紫外檢測即可。

*注意事項(xiàng):與瓊酯糖凝膠不同,不能用預(yù)染或點(diǎn)染的方法;只能用泡染的方法顯色,由于聚丙烯酰胺比較致密,染料不容易深入,顯色效果沒有瓊酯糖凝膠好。

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特別提醒:

1)SafeStain同時(shí)適用于紫外成像儀,激光成像儀和藍(lán)光儀,下觀測的核酸電泳染料!

2)?Page膠實(shí)驗(yàn)室燈光下,肉眼可觀測條帶,?不需要外源激發(fā)光(包括紫外和藍(lán)光)。

3)?本公司所有產(chǎn)品僅限于專業(yè)人員用于生命科學(xué)研究,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅。

4)?本公司所有產(chǎn)品必須由合格專業(yè)技術(shù)人員操作同時(shí)佩戴口罩/手套/實(shí)驗(yàn)服并遵守生物實(shí)驗(yàn)室安全操作規(guī)程!

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