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Super Green qPCR mix (~Sybr Green  qPCR mix,None/Low/High ROX & Universal)

Super Green qPCR mix (~Sybr Green qPCR mix,None/Low/High ROX & Universal)

Super Green qPCR mix?(~Sybr Green ?qPCR mix)(None/Low/High ROX & Universal)?包裝量:組成50次x 50μL反應(yīng)體系200次x 50μL反應(yīng)體系2×?Super Green qPCR Mix1.25 mL1.25 mL×4?產(chǎn)品儲(chǔ)存:?-20 ℃?避光保存12個(gè)月,使用前充分溶解混勻。Mix?融解后可在?4℃避光條件下穩(wěn)定存放一個(gè)月,盡量避免反復(fù)凍融。產(chǎn)品簡(jiǎn)介:本制品是采用Super Green(~Sybr Green)嵌合熒光法進(jìn)行Real Time PCR的專用試劑,為?2×?預(yù)混液。已經(jīng)將DNA聚合酶、dNTP、特殊穩(wěn)定劑、優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液、BSA和SYBR Green I等試劑預(yù)混成一種適合Real Time P...

Super Green qPCR mix?(~Sybr Green ?qPCR mix)(None/Low/High ROX & Universal)

?

包裝量:


組成

50次x 50μL反應(yīng)體系

200次x 50μL反應(yīng)體系

2×?Super Green qPCR Mix

1.25 mL

1.25 mL×4

?

產(chǎn)品儲(chǔ)存:?-20 ℃?避光保存12個(gè)月,使用前充分溶解混勻。Mix?融解后可在?4℃避光條件下穩(wěn)定存放一個(gè)月,盡量避免反復(fù)凍融。

產(chǎn)品簡(jiǎn)介:

本制品是采用Super Green(~Sybr Green)嵌合熒光法進(jìn)行Real Time PCR的專用試劑,為?2×?預(yù)混液。已經(jīng)將DNA聚合酶、dNTP、特殊穩(wěn)定劑、優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液、BSA和SYBR Green I等試劑預(yù)混成一種適合Real Time PCR反應(yīng)檢測(cè)用2×Premix Type試劑,?使用時(shí)只需加入模板、引物和水,可減少操作步驟,縮短加樣時(shí)間,降低污染幾率,?具有靈敏度高、特異性強(qiáng)、穩(wěn)定性好等特點(diǎn)。其核心組分是抗體修飾的熱啟動(dòng)?Taq DNA?聚合酶,配合精心優(yōu)化的Buffer體系,有效抑制非特異性擴(kuò)增,可對(duì)寬廣濃度范圍的模板進(jìn)行準(zhǔn)確定量,獲得穩(wěn)定可靠的?qPCR?結(jié)果,可在寬廣的定量區(qū)域內(nèi)得到良好的標(biāo)準(zhǔn)曲線,對(duì)目的基因進(jìn)行準(zhǔn)確定量檢測(cè),重復(fù)性好,可信度高。

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使用方法

1.?注意事項(xiàng):?所有產(chǎn)品僅限用于研發(fā),必須生物技術(shù)人員操作同時(shí)佩戴口罩/手套/實(shí)驗(yàn)服并遵守生物實(shí)驗(yàn)室安全操作規(guī)程!

1)???????本制品不含參比染料ROX,客戶可根據(jù)qPCR儀器技術(shù)指導(dǎo)決定是否需要加ROX參比染料,用于消除信號(hào)本底以及校正孔與孔之間產(chǎn)生的熒光信號(hào)誤差。

2)???????本制品含Super Green I?強(qiáng)光下易分解,降低靈敏度,使用時(shí)避免長(zhǎng)時(shí)間強(qiáng)光照射本制品。

3)???????建議在冰上配制PCR反應(yīng)液,再放入PCR儀器中擴(kuò)增??梢蕴岣邤U(kuò)增特異性,減少背景。

4)???????使用前上下顛倒輕輕混勻?Mix,請(qǐng)勿渦旋振蕩混勻,避免產(chǎn)生過(guò)多氣泡。

5)???????推薦的引物終濃度為?0.2μM,可在?0.1~1μM?范圍內(nèi)優(yōu)化。

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2.?實(shí)驗(yàn)優(yōu)化?若使用默認(rèn)反應(yīng)條件反應(yīng)性能不佳時(shí),則需要進(jìn)行反應(yīng)條件的優(yōu)化,可以從引物濃度以及擴(kuò)增程序兩個(gè)方面進(jìn)行:

①?引物濃度調(diào)整:當(dāng)引物終濃度在0.1~1.0μM范圍之間變化時(shí),引物濃度越低,?擴(kuò)增特異性越高,但擴(kuò)增效率會(huì)有所下降。

②?擴(kuò)增程序優(yōu)化:需提高擴(kuò)增特異性,可使用兩步法程序或提高退火溫度;需提高擴(kuò)增效率,可使用三步法程序或延長(zhǎng)延伸時(shí)間。

?

3.?引物設(shè)計(jì)原則:

a)???????擴(kuò)增產(chǎn)物長(zhǎng)度建議控制在?80~200 bp;引物長(zhǎng)度為?18~25 bp;

b)???????正向引物和反向引物的?Tm?值相差不超過(guò)?1℃為佳,Tm值控制在58~62℃為佳;

c)???????引物的?GC?含量控制在?40%~60%?之間;引物?3'?端最后一個(gè)堿基最好為?G?或者?C;

d)???????引物?A、G、C、T?整體分布盡量要均勻,避開(kāi)?T/C?或者?A/G?的連續(xù)結(jié)構(gòu)(特別是?3'?端);

e)???????避開(kāi)引物內(nèi)部或者兩條引物之間的互補(bǔ)序列;

f)???????使用NCBI BLAST功能檢索確認(rèn)引物的特異性。

4.?建議PCR反應(yīng)體系(以50μL反應(yīng)體系為例,反應(yīng)液配制請(qǐng)?jiān)诒线M(jìn)行)

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Components

Volume

Final Concentration

2×?Super Green qPCR Mix

25 μL

DNA Template??DNA模版

2 μL

50~1000ng/50uL

(最低可達(dá)5pg/50uL)

Forward Primer (10 μM)??正向引物

1 μL

0.2 μM each

Reverse Primer (10 μM)??反向引物

1 μL

0.2 μM each

ddH2O to final volume總體積調(diào)節(jié)到50uL

To 50μL

Not applicable

?

5. qPCR?反應(yīng)程序(可根據(jù)機(jī)型適當(dāng)調(diào)整)

三步法

兩步法

步驟

溫度

時(shí)間


步驟

溫度

時(shí)間


預(yù)變性

95 ℃

30sec


預(yù)變性

95 ℃

30sec


變性

95 ℃

10sec

變性

95 ℃

10sec

退火a

55~65℃

10sec

退火a&延伸a

60℃

30sec

延伸a

72 ℃

30sec

溶解曲線b

使用儀器默認(rèn)采集程序


溶解曲線b

使用儀器默認(rèn)采集程序


a.?根據(jù)引物的Tm?值進(jìn)行退火(退火&?延伸)溫度的設(shè)定;若擴(kuò)增片段在200 bp?以內(nèi),延伸(退火&?延伸)時(shí)間可以設(shè)置為15 sec;此外,延伸時(shí)間的設(shè)置還需根據(jù)qPCR?儀所需要的數(shù)據(jù)采集最短時(shí)間限制自行調(diào)整;

b.?不同qPCR?儀的熔解曲線采集程序有差別,一般可使用儀器默認(rèn)的熔解曲線采集程序。

?

6.?適配機(jī)型:

產(chǎn)品

適用機(jī)型

25uM ROX?用量

(50uL PCR反應(yīng)體系)

ROX?終濃度

2×?Super Green qPCR Mix

(none ROX)

Bio-Rad CFX?全系列;

Roche LightCycler??系列;

Eppendorf Mastercycler? ep realplex?系列;

Qiagen/Corbett Rotor-Gene??系 列;?

Takara Thermal Cycler Dice;

Analytikjena qTOWER系列等

0uL

?

0nM

2×?Super Green qPCR Mix

(Low ROX)

ABI 7500/7500 Fast,ABI ViiA 7?;

ABI QuantStudio???系 列;

Stratagene Mx3000P?/3005P?/4000?

0.05uL (0.05uL~0.1uL)

25nM~50nM

2×?Super Green qPCR Mix

(High ROX)

ABI 7000/7300/7700/7900 HT/7900 HT Fast,

StepOne?,StepOne Plus??等

0.5uL (0.5uL~1uL)

250nM~500nM

?

?

常見(jiàn)問(wèn)題:

?

問(wèn)題描述

可能原因

解決辦法

擴(kuò)增曲線不光滑

熒光信號(hào)太弱,經(jīng)系統(tǒng)校正后產(chǎn)生

確保?Mix?中預(yù)混的染料未降解;更換熒光信號(hào)收集更好的?qPCR?專用耗材

擴(kuò)增曲線斷裂或下滑

模板濃度較高,基線的終點(diǎn)值大于Cq值

減小基線終點(diǎn)?(Cq?值?-4), 重新分析數(shù)據(jù)

個(gè)別孔擴(kuò)增曲線突然驟降

反應(yīng)管內(nèi)留有氣泡

確保?Mix?完全溶解,請(qǐng)勿渦旋振蕩混勻加樣完成后輕彈離心去除氣泡

延長(zhǎng)預(yù)變性時(shí)間至?10 min,以去除氣泡

?

反應(yīng)結(jié)束無(wú)擴(kuò)增曲線出現(xiàn)

反應(yīng)循環(huán)數(shù)偏少

設(shè)置循環(huán)數(shù)為?40,但更多的循環(huán)數(shù)會(huì)增加過(guò)多的背景信號(hào)

熒光信號(hào)采集步驟未設(shè)置或者設(shè)置錯(cuò)誤

兩當(dāng)步將法信擴(kuò)號(hào)增采程集序設(shè)一置般在將信號(hào)采集設(shè)置在退火?&?延伸階段,

三步法擴(kuò)增程序應(yīng)72℃延伸階段

引物可能降解

長(zhǎng)期未用的引物,應(yīng)先通過(guò)?PAGE?電泳檢測(cè)完整性,以排除其降解的可能

模板濃度過(guò)低

減少模板稀釋倍數(shù)重復(fù)實(shí)驗(yàn),樣品濃度未知的情況下先從最高濃度做起

模板降解

重新制備模板,重復(fù)實(shí)驗(yàn)

?

Cq?值出現(xiàn)過(guò)晚

擴(kuò)增效率低

提高引物濃度,嘗試三步法擴(kuò)增程序,或者重新設(shè)計(jì)引物

模板濃度過(guò)低

減少模板稀釋倍數(shù)重復(fù)實(shí)驗(yàn),樣品濃度未知的情況下先從最高濃度做起

模板降解

重新制備模板,重復(fù)實(shí)驗(yàn)

擴(kuò)增產(chǎn)物過(guò)長(zhǎng)

擴(kuò)增產(chǎn)物長(zhǎng)度控制在?80~200 bp

體系中存在?P

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